MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 27349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	ACA	3	9	136	144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602061
2	NC_008610	TTA	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
3	NC_008610	TAA	2	6	188	193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602061
4	NC_008610	TCAAA	2	10	206	215	60 %	20 %	0 %	20 %	118602061
5	NC_008610	CACAA	2	10	226	235	60 %	0 %	0 %	40 %	118602061
6	NC_008610	TAT	2	6	413	418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
7	NC_008610	AC	3	6	444	449	50 %	0 %	0 %	50 %	118602061
8	NC_008610	A	7	7	481	487	100 %	0 %	0 %	0 %	118602061
9	NC_008610	CTG	2	6	592	597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602061
10	NC_008610	TAT	2	6	601	606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
11	NC_008610	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602061
12	NC_008610	AGGAA	2	10	632	641	60 %	0 %	40 %	0 %	118602061
13	NC_008610	AAG	2	6	649	654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602061
14	NC_008610	T	6	6	657	662	0 %	100 %	0 %	0 %	118602061
15	NC_008610	ATT	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
16	NC_008610	TGC	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602061
17	NC_008610	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	118602061
18	NC_008610	AGA	2	6	869	874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602061
19	NC_008610	TTTA	2	8	881	888	25 %	75 %	0 %	0 %	118602061
20	NC_008610	CTT	2	6	933	938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118602061
21	NC_008610	TTG	2	6	952	957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602061
22	NC_008610	AAAT	2	8	967	974	75 %	25 %	0 %	0 %	118602061
23	NC_008610	ACA	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602061
24	NC_008610	A	7	7	1248	1254	100 %	0 %	0 %	0 %	118602061
25	NC_008610	A	6	6	1286	1291	100 %	0 %	0 %	0 %	118602061
26	NC_008610	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602061
27	NC_008610	AT	3	6	1334	1339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008610	CAAC	2	8	1341	1348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008610	CTAA	2	8	1353	1360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008610	AAC	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008610	TAA	2	6	1374	1379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008610	T	7	7	1416	1422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008610	TAA	5	15	1507	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008610	T	6	6	1536	1541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008610	ACT	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602062
36	NC_008610	TTA	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
37	NC_008610	A	8	8	1607	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	118602062
38	NC_008610	TTCT	2	8	1628	1635	0 %	75 %	0 %	25 %	118602062
39	NC_008610	A	6	6	1719	1724	100 %	0 %	0 %	0 %	118602062
40	NC_008610	AAG	2	6	1727	1732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602062
41	NC_008610	A	7	7	1776	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	118602062
42	NC_008610	AGA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602062
43	NC_008610	TAA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602062
44	NC_008610	ATC	2	6	1874	1879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602062
45	NC_008610	A	6	6	1905	1910	100 %	0 %	0 %	0 %	118602062
46	NC_008610	ATT	2	6	1918	1923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
47	NC_008610	ACTT	2	8	1996	2003	25 %	50 %	0 %	25 %	118602062
48	NC_008610	TTG	4	12	2039	2050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602062
49	NC_008610	AAAC	2	8	2086	2093	75 %	0 %	0 %	25 %	118602062
50	NC_008610	A	6	6	2110	2115	100 %	0 %	0 %	0 %	118602062
51	NC_008610	ACT	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602062
52	NC_008610	CATT	2	8	2190	2197	25 %	50 %	0 %	25 %	118602062
53	NC_008610	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
54	NC_008610	TTA	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
55	NC_008610	TAA	2	6	2226	2231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602062
56	NC_008610	TAT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
57	NC_008610	CAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602062
58	NC_008610	ATT	2	6	2314	2319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
59	NC_008610	ACA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602062
60	NC_008610	GAA	2	6	2368	2373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602062
61	NC_008610	T	6	6	2420	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	118602062
62	NC_008610	GAAATT	2	12	2482	2493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602062
63	NC_008610	ATTA	2	8	2503	2510	50 %	50 %	0 %	0 %	118602062
64	NC_008610	AC	3	6	2535	2540	50 %	0 %	0 %	50 %	118602062
65	NC_008610	TTA	2	6	2587	2592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
66	NC_008610	AGT	2	6	2593	2598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602062
67	NC_008610	ATGA	2	8	2599	2606	50 %	25 %	25 %	0 %	118602062
68	NC_008610	TGT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602062
69	NC_008610	A	6	6	2664	2669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008610	TA	3	6	2711	2716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008610	ATT	2	6	2718	2723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008610	TTAA	2	8	2728	2735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008610	ATTAT	2	10	2763	2772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008610	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008610	ATTTA	2	10	2819	2828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008610	ATA	2	6	2843	2848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008610	TAC	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008610	ATCT	2	8	2899	2906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008610	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008610	TTAT	2	8	2927	2934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008610	GAT	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
82	NC_008610	GTT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602063
83	NC_008610	TGA	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
84	NC_008610	GCA	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602063
85	NC_008610	AGG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118602063
86	NC_008610	TGA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
87	NC_008610	TGT	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602063
88	NC_008610	ATTT	2	8	3375	3382	25 %	75 %	0 %	0 %	118602063
89	NC_008610	T	6	6	3481	3486	0 %	100 %	0 %	0 %	118602063
90	NC_008610	TCTT	2	8	3537	3544	0 %	75 %	0 %	25 %	118602063
91	NC_008610	GAAA	2	8	3586	3593	75 %	0 %	25 %	0 %	118602063
92	NC_008610	T	7	7	3596	3602	0 %	100 %	0 %	0 %	118602063
93	NC_008610	GGT	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602063
94	NC_008610	A	6	6	3650	3655	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
95	NC_008610	TAA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602063
96	NC_008610	TAT	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
97	NC_008610	CAAT	2	8	3679	3686	50 %	25 %	0 %	25 %	118602063
98	NC_008610	TGA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
99	NC_008610	ACAA	2	8	3762	3769	75 %	0 %	0 %	25 %	118602063
100	NC_008610	GGT	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602063
101	NC_008610	TAA	2	6	3833	3838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602063
102	NC_008610	TAA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602063
103	NC_008610	A	6	6	3864	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
104	NC_008610	A	6	6	3871	3876	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
105	NC_008610	ATT	2	6	3918	3923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
106	NC_008610	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602063
107	NC_008610	TGAA	2	8	4012	4019	50 %	25 %	25 %	0 %	118602063
108	NC_008610	TATT	2	8	4032	4039	25 %	75 %	0 %	0 %	118602063
109	NC_008610	ATT	3	9	4062	4070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
110	NC_008610	CGT	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602063
111	NC_008610	CAAA	2	8	4185	4192	75 %	0 %	0 %	25 %	118602063
112	NC_008610	CTA	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602063
113	NC_008610	T	7	7	4213	4219	0 %	100 %	0 %	0 %	118602063
114	NC_008610	A	6	6	4330	4335	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
115	NC_008610	TAT	2	6	4336	4341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
116	NC_008610	AGA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602063
117	NC_008610	TAT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
118	NC_008610	AATT	2	8	4513	4520	50 %	50 %	0 %	0 %	118602063
119	NC_008610	ACC	2	6	4547	4552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602063
120	NC_008610	A	6	6	4566	4571	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
121	NC_008610	ATT	2	6	4615	4620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
122	NC_008610	AAG	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602063
123	NC_008610	ATG	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
124	NC_008610	GGCAT	2	10	4683	4692	20 %	20 %	40 %	20 %	118602063
125	NC_008610	ATT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
126	NC_008610	TGA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
127	NC_008610	A	7	7	4816	4822	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
128	NC_008610	GCA	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602063
129	NC_008610	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118602063
130	NC_008610	A	7	7	5022	5028	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
131	NC_008610	GAAAA	2	10	5061	5070	80 %	0 %	20 %	0 %	118602063
132	NC_008610	T	6	6	5111	5116	0 %	100 %	0 %	0 %	118602063
133	NC_008610	A	6	6	5130	5135	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
134	NC_008610	AAC	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602063
135	NC_008610	TTG	2	6	5251	5256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602063
136	NC_008610	AGA	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602063
137	NC_008610	A	8	8	5353	5360	100 %	0 %	0 %	0 %	118602063
138	NC_008610	A	7	7	5390	5396	100 %	0 %	0 %	0 %	118602064
139	NC_008610	GTA	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602064
140	NC_008610	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602064
141	NC_008610	AAC	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602064
142	NC_008610	TTA	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602064
143	NC_008610	AGAAA	2	10	5472	5481	80 %	0 %	20 %	0 %	118602064
144	NC_008610	A	6	6	5553	5558	100 %	0 %	0 %	0 %	118602064
145	NC_008610	AAG	2	6	5560	5565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602064
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147	NC_008610	TTTCT	2	10	5579	5588	0 %	80 %	0 %	20 %	118602064
148	NC_008610	ATTT	2	8	5608	5615	25 %	75 %	0 %	0 %	118602064
149	NC_008610	A	6	6	5617	5622	100 %	0 %	0 %	0 %	118602064
150	NC_008610	CGT	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602064
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154	NC_008610	A	6	6	5757	5762	100 %	0 %	0 %	0 %	118602064
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157	NC_008610	AGT	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602064
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162	NC_008610	TC	3	6	5998	6003	0 %	50 %	0 %	50 %	118602064
163	NC_008610	AAACA	2	10	6116	6125	80 %	0 %	0 %	20 %	118602064
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171	NC_008610	AATT	2	8	6382	6389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008610	T	6	6	6400	6405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008610	AC	3	6	6418	6423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_008610	A	6	6	6432	6437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008610	TA	3	6	6442	6447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008610	TTA	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008610	CTAT	2	8	6497	6504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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180	NC_008610	TAC	2	6	6663	6668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_008610	ATG	2	6	6733	6738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008610	AGAA	2	8	6787	6794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_008610	ATA	2	6	11417	11422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602068
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275	NC_008610	AAG	2	6	11467	11472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602068
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277	NC_008610	ATT	2	6	11508	11513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602068
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